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Biologia Molecolare e Cellulare

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Anno accademico 2011/2012

Codice dell'attività didattica
MFN0375
Docenti
Prof. Daniela Taverna (Titolare, Responsabile del corso)
Prof. Michele De Bortoli (Titolare)
Corso di studi
Scienze Biologiche D.M. 270
Anno
2° anno
Periodo didattico
I semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
9 (3+6)
SSD dell'attività didattica
BIO/06 - anatomia comparata e citologia
BIO/11 - biologia molecolare
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Sommario insegnamento

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Programma


Modulo 1. Biologia Molecolare            
Strutture molecolari: DNA, RNA, ed interazioni tra macromolecole    
Replicazione, mutazione, riparazione e ricombinazione del DNA    
Organizzazione del gene in procarioti ed eucarioti ed introduzione all’organizzazione dei genomi.      
Metabolismo degli RNA: Trascrizione, processamento e trasporto. Splicing alternativo.        
Sintesi delle proteine, modificazioni post-traduzionali e sorting    
Regolazione dell’espressione genica: controllo locale e globale della trascrizione, e regolazione post-trascrizionale    
Introduzione alle tecniche di clonaggio molecolare, sequenziamento del DNA, PCR e metodologie di analisi.
Attività di Laboratorio pratica individuale: amplificazione di DNA bersaglio con PCR    

Modulo 2. Biologia Cellulare            
Comunicazione cellulare autocrina, paracrina, justacrina, endocrina.    
Trasduzione: Recettori citoplasmatici e nucleari       
Trasduzione recettori di membrana: 7 domini transmembrana proteine-G trimeriche, PLC beta    6    
RTK e per citochine: PLC gamma, PI3-k, via di Ras e delle MAPK, JAK, STAT. Recettori serine-treonine cinasi    
Proliferazione, differenziamento, migrazione, omeostasi, turnover    
Principi delle colture cellulari in vitro    


In the first part of the course, students will acquire basic knowledge on the molecular mechanisms devoted to the maintenance, replication, transcription and translation of genetic information, with reference to the cell compartments where they work. A central point of this course is the interaction between macromolecules to attain the regulatory level and cell homeostasis. A basic methodological knowledge on DNA cloning, sequencing and transfection, is also a goal of this course. Indeed, students will acquire basic experience on amplification by PCR and analysis of DNA. The following items will be presented:

Part 1: Molecular Biology
-Structure of DNA, RNA and molecular interactions
-DNA replication, mutations, repair and recombinations
-How is a Prokaryotic or Eukaryotic gene organized? Organization of the genomes
-RNA transcription, processing and transport. Alternative splicing
-Protein Synthesis, post-translational modifications and sorting
-Control of gene expression: local and global control of geen transcrption; Post-transcriptional regulations
-A first approach to  cloning techniques, DNA sequencing, PCR set up and analysis of fragments.
-A practical approach: every student will set up some PCR reactions for cDNA and genomic DNA.

Part 2: Cell Biology
•    Cell communication: autocrine, paracrine, justacrine, endocrine modalities.
•    Signal transduction : citoplasmatic and nuclear receptors
•    Signal transduction by membrane receptors: 7-helix transmembrane receptors, trimeric G proteins, PLC beta.
•    Signal transduction by membrane receptors: PLC-gamma, PI3-K, RAS-MAPK pathways, JAK, STATA. Serine-threonine kinase receptors.
•    Cell proliferation, differentiation, migration, homeostasis, turnover.
•    Cell counting and cell culture
 


Nel primo modulo del corso, lo studente acquisirà una conoscenza di base sui meccanismi molecolari responsabili del mantenimento, replicazione, trascrizione e traduzione dell’informazione genetica, integrandoli nel contesto cellulare in cui essi avvengono. Un concetto importante di questo corso è come le diverse macromolecole cellulari interagiscano tra di loro per ottenere un livello di regolazione ed omeostasi cellulare. La prospettiva metodologica di base, che riguarda le basi del clonaggio e sequenziamento del DNA e delle trasfezioni, costituisce una ulteriore finalità del corso, insieme ad una acquisizione di manualità pratica di base per l’amplificazione ed analisi del DNA.  

Nel secondo modulo del corso, lo studente apprenderà le basi della comunicazione cellulare e della trasduzione del segnale, insieme ai meccanismi fondamentali della proliferazione, differenziamento, migrazione, omeostasi e turnover cellulare. Verrà inoltre introdotto ai concetti di base della coltura cellulare in vitro, con pratica di manipolazione cellulare ed elementi di igiene e sicurezza.


I testi base consigliati per il corso sono:
1.    (Mod. Molecolare) L. A. Allison: “Fondamenti di Biologia Molecolare”, Zanichelli Editore.
2.    (Mod. Cellulare) G. M. Cooper, R.E. Hausman: “La Cellula: un approccio molecolare”, Piccin Editore.
In alternativa:
•    H Lodish et al. “Biologia Molecolare della Cellula, Zanichelli (3° edizione 2009).
oppure
•    B Alberts et al., “Biologia Molecolare della Cellula”, Zanichelli (5° edizione 2009; 4° ed.).


I siti internet di interesse sono elencati su:
http://biologia.campusnet.unito.it/cgi-bin/home.pl  
http://biologia.i-learn.unito.it/


La verifica si svolge principalmente con prova scritta(*) organizzata in due test separati, ma eseguiti di seguito, sui due moduli:
Il test di Biologia Molecolare contiene:
A) La sezione A contiene 23 domande, a risposta multipla o a completamento o di riconoscimento su concetti fondamentali.
B) La parte B contiene 35 domande come sopra su aspetti più specifici di tutti gli argomenti trattati nel corso.
Lo studente che totalizza almeno “21” con A+B può eseguire un ulteriore test parte C con 6 domande aperte/problemi di difficoltà più elevata.
Il voto sarà proporzionale sia al numero di parti completate, sia alla percentuale di risposte corrette.
Il test di Biologia Cellulare contiene:
15 domande a risposta multipla o a completamento o di semplice calcolo.
Verrà valutata la partecipazione alle esercitazioni on-line con un massimo di 3 punti.
(*): di norma svolti sulla piattaforma Moodle su computer in aula.

Valutazione complessiva.
La somma dei punteggi entra a fare parte in modo ponderato nel voto (BC massimo 10 punti +BM massimo 20 punti = voto/30).
Gli studenti che hanno raggiunto la sufficienza sono ammessi all’orale. La prova orale è unica e verte sull’insieme del programma del corso. Può essere concessa agli studenti la facoltà di rinunciare alla parte orale.

Modifica da 15/2/2012 - Le domande B sono scese a 33, mentre la parte C è stata aumentata a 8 domande. Questo a segito di un'analisi dei risultati degli a.a. precedenti, che ha mostrato necessità di riequilibrio sulla distribuzione dei voti.

Propedeuticità per immatricolati 2010/2011: Biologia della cellula e dei tessuti - Chimica Organica
Propedeuticità per immatricolati 2011/2012: Biologia della cellula e dei tessuti - Chimica Organica - Chimica generale e inorganica

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria; per i corsi di laboratorio e le attività di esercitazione relative ai corsi la frequenza è obbligatoria e non può essere inferiore al 70% delle ore previste.  





Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

  1. (Mod. Molecolare) L. A. Allison: “Fondamenti di Biologia Molecolare”, Zanichelli Editore.

In alternativa:

  • H Lodish et al. “Biologia Molecolare della Cellula, Zanichelli (3° edizione 2009).

oppure

  • B Alberts et al., “Biologia Molecolare della Cellula”, Zanichelli (5° edizione 2009; 4° ed.).

2. (Mod. Cellulare) - Lodish o Alberts sono sufficienti. Se si studia il Mod. Molecolare con Allison, è necessario integrare con un testo di Biologia Cellulare ( es: Cooper GM - Hausman RE "La Cellula un Approccio Molecolare" II edizione, PICCIN Editore).

I siti internet di interesse sono elencati su questo sito e su http://biologia.i-learn.unito.it/



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Note

Il corso è obbligatorio per il Curriculum Biomolecolare Cellulare, Curriculum Ecologico Ambientale.

Attenzione! il corso comprende attività obbligatorie: 1) 1 esercitazione di laboratorio (PCR) obbligatorio al 100%) di 8 ore totali, a turni, con verifica della frequenza. L'esame non potrà essere sostenuto in assenza della firma di frequenza. 2) Attività e verifiche sulla piattaforma Moodle. La verifica della frequenza sarà una componente della valutazione finale.

IMPORTANTE: il materiale didattico, gli esercizi e le attività tutoriale, nonchè i turni di laboratoro, sono disponiili sulla pittaforma moodle:

http://biologia.i-learn.unito.it/course/view.php?id=208

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Moduli didattici

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Ultimo aggiornamento: 28/09/2012 10:10
Location: https://biologia.campusnet.unito.it/robots.html
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